Vážení hubramáci,

dovoluji si vás pozvat na vzdělávací workshop, který budeme realizova 25.4.2012 v Brně (posluchárna neurologické kliniky, budova C, FN u sv. Anny, Pekařská 53, Brno). Začátek workshopu bude v 9:00 a předpokládaný konec mezi 13:00 a 14:00. Uprostřed bude přestávka se zajištěním (snad) nějakého občerstvení.
Obsah workshopu by měl pokrát následující témata: Princip fMRI, základní i pokročilá analýza fMRI dat (GLM/SPM, ICA), konektivita, artefakty a šum ve fMRI, modelování HRF, základy EEG-fMRI a související. V nejbližších dnech zde a na http://fmri.mchmi.com zveřejníme podrobnější program. Workshop bude směřován především pro PHD studenty, začínající výzkumníky v oblasti fMRI a další osoby, které se o fMRI (a zejména analýze fMRI dat) chtějí něco více dovědět a nyní mají jen základní povědomí.
Účast na akci je zdarma, ale prosíme o registraci z důvodu kapacity. Registrujte se emailem (michal.mikl@ceitec.muni.cz) s uvedením svého jména a instituce.

Milá kolegyně, milý kolego,

v souvislosti se založením HuBraM sekce ČSKN ČLS JEP na fMRI workshopu v Olomouci se chystáme pro zájemce zprostředkovat nákup trička s logem
HuBraM, tak jak jsou zobrazena na hrudích pionýrů naší sekce. Aktuálně je možno si objednat tričko s následujícími příznaky:

• odlišného střihu pro mužskou a ženskou postavu:  M/F;
• velikosti: S/M/L/XL/XXL/XXXL/XXXXL;
• barva černá (doporučená) nebo bílá: B/W;
• tiskem loga vpředu nebo vpředu i na zádech:  SS/DS;
• kvality materiálu biobavlna vs. obyč.: 1/2.

Možná máte výborný nápad jak lépe zpracovat data, která ukazují na falešné korelace v „resting state“ funkční konektivitě (Jonathan D. Power, et al. Spurious but systematic correlations in functional
connectivity MRI networks arise from subject motion, NeuroImage, Volume 59, Issue 3, 1 February 2012, Pages 2142-2154)?

Nevěšte hlavu, autoři data uvolnili a můžete je nalézt zde společně s dalšími, víc než tisíci, záznamy v projektu ‘1000 Functional Connectomes’ http://fcon_1000.projects.nitrc.org/.

Pokud nabízíte kvalitní data, přidejte se.

Vážení HuBraMáci,v návaznosti na příspěvek ke škole klinické neurofyziologie a snahu o zpřístupnění vzdělávacích materiálů si dovolím zmínit akci, která proběhla v Brně v prosinci 2010. Jelikož fMRI výzkum v Brně slavil v roce 2010 již desetileté výročí, uspořádali jsme seminář, na němž byly představeny průřezově témata, kterými se nerozobrazovací brněnský tým zabýval, následovaný vzdělávacím workshopem, na němž jsme se snažili vysvětlit principy funkční magnetické rezonance, základní i některé pokročilé přístupy v analýze fMRI dat a témata z analýzy konektivity. Prezetnace ze vzdělávací části jsou nyní pro členy HuBraMu přístupné pod správcem souborů v adresáři users/10 let fMRI v Brně a přímé odkazy jsou umístěné i v tomto článku.

Vážení HuBraMáci,

V současné době jsou k dispozici následující oblasti zájmu:

Stručné představení správce souborů

V levém navigačním menu naleznete položku správce souborů, která vede do složky http://hubram.cz/files (můžete používat přímý odkaz tam), kde je k dispozici adresářová struktura share/users a dále (použit systém webfm). Nové soubory se do aktuální složky (jejíž obsah je zobrazen v pravé části okna) nahrávají pomocí File Upload. Jedinou atypickou věcí je zde kontextové menu vyvolané PRAVÝM myšítkem, to jest ležícím na opačné straně myši než by jeden při prohlížení internetu čekal. Při kliknutí v levém adresářovém stromu můžete přidat adresář nebo vyhledávat, vpravo je možností více - adresáře lze mazat, přejmenovat. U souborů je možností ještě více - prohlížení metadat (například rozlišení obrázků), stažení souboru, a nastavení přístupovým práv (viz níže).

Před 17 dny byl do ostrého provozu spuštěn tento portál. Čeho bylo zatím dosaženo:

• všech 13 členů přípravného výboru má funkční účet
• další 4 zájemci se zaregistrovali na stránkách
• google nás vzal na vědomí a konečně jsme přeskočili dvě méně relevantní stránky (ČSKN a jakýsi comming soon hubram tečka com, takže vypadáváme na prvním místě po zadání termínu "hubram")
• naše stránky se zobrazují  ve vyhledávači seznam.cz
• je plně funkční přihlašování přes openID (momentálně využívají 4 uživatelé)
• doladěn osobní formulář, vytvořeny základní kategorie ("štítky")

Na co se můžete těšit:

• integrace s kalendářem na Facebooku (29.12.2011 funkční beta verze )
• systém nahrávání souborů (31.12.2011 - soubory jsou k dispozici všem registrovaným uživatelům, funguje nahrávání i stahování)
• fotky HuBraM triček - registrovaným jsou k dispozici od 8.1.2012 v sekci Správce souborů  share/users/Trička
• nějaké návody/manuály k těmto stránkám (po správci souborů asi také představení dalších pokročilých funkcí)
  

Vážení přátelé,

po roce pozvolných příprav a iniciačních diskusí týkajících se vzniku sekce pro funkční mapování mozku se stav věci výrazněji posunul a nyní směřujeme k vlastnímu vzniku sekce. Tento akt by měl snad proběhnout na jaře 2012 v návaznosti na olomoucký fMRI workshop.

Zanedlouho po vytvoření stránek nás navštívil strýček google - 9.12.2011 si prohlédl naše stránky a vzal je na vědomí. Za šest dní pochopitelně nemáme žádný PageRank, ale i přesto jsem do zápatí stránky umístil měřič této veličiny. Tak uvidíme, kdy se nám zvedne ;-).