Sekce pro funkční mapování mozku

Vážení Hubramáci,

pro ty z vás a vašich kolegů, kteří mají zajímavé náměty na realizaci neurozobrazovacích a eletkrofyziologických studií, ale nemají přístup k potřebnému vybavení je zde nabídka Laboratoře multimodálního a funkčního zobrazování - MAFIL, která je zřízena v rámci CEITEC MU. MAFIL nabízí prostřednictvím národní infrastrukutry CzechBioImaging otevřený přístup (open access) všem uživatelům z ČR i ze zahraničí. Nabízené služby zahrnují jak přístup k vlastnímu měření (zejména 3T MR a HD EEG), tak i určitou podporu při přípravě studie a měřícího protokolu či při zpracování dat.

Bližší informace o vybavení laboratoře a možnostech měření naleznete na stránkách laboratoře http://www.ceitec.cz/mafil

Informace k open access přístupu naleznete na stránkách https://www.czech-bioimaging.cz/application-forms

Vážení hubramáci,

v Brně tradičně pořádáme podzimní vzdělávací kurz (workshop) zaměřený na neurozobrazování. Tentokrát ve dnech 14.-16.11.2016. Cílová skupina jsou zejména phd a magisterští studenti a výzkumníci seznamující se s neurozbrazováním.

Bližší informace v přiložené pozvánce.

Za organizátory srdečně zve Michal Mikl

Vážení hubramáci,

dovoluji si vás pozvat na již tradičně připravovaný vzdělávací workshop 7.4.2016 v Brně, který přímo předchází olomouckému mezinárodnímu workshopu funkční magentické rezonance.

Brněnský workshop se bude konat ve čtvrtek 7.4. od 9:00 v místnosti 211 v budově CEITEC MU (Kamenice 5, Univerzitní kampus - Brno Bohunice, vchod z ulice Studentská od zastávky "Univerzitní kampus - sever"). Očekávaný konce je ve 13:00. Do 14:00 je prostor na oběd a ve 14:00 bude odjíždět minibus do Olomouce, kde týž den večer začíná olomoucký workshop.

Registrace na brněnský workshop je bezplatná - registrujte se , prosím, na email michaela.vanharova@ceitec.muni.cz a uveďte zájem o dopravu do Olomouce. Ta je také zdarma (podpořena ČSKN).

Letošní workshop se tématicky bude věnovat novým tehcnologiím v MR zobrazování, zejména s ohledem na funkční a strukturní mapování mozku. Prezentace budou v angličtině. DIskuse je možná také v češtině a slovenštině. Bližší informace jsou na přiložené pozvánce.

Za organizační tým srdečně zve
Michal Mikl

Masarykova univerzita, Středoevropský technologický institut - CEITEC, vypisuje výběrové řízení na pozici laborant/operátor přístrojů v Laboratoři multimodálního a funkčního zobrazování (MAFIL).

Bližší informace naleznete na webu CEITEC nebo MUNI.

Základní informaec přinášíme i zde.
Hlavní náplň práce:

• Obsluha elektroyziologických přístrojů a MR tomografů v CF MAFIL
• Uživatelská podpora výzkumníkům při práci v laboratořích
• Zajištění odborného dohledu, bezpečnosti a provozní údržby laboratoří

Výše úvazku 1,0. Nástup od 1. 3. 2016 popř. dohodou

Přihlášky doložené profesním životopisem zasílejte nejpozději do 29. 1. 2016 na emailovou adresu lenka.krskova@ceitec.cz. Do předmětu zprávy zadejte název pozice.

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na vzdělávcí workshop zaměřený na neurozobrazování (fMRI, morfometrie, DTI) a elektrofyziologii (EEG, simultánní elektrofyziologie v MR). Workshop bude dvoudenní (11.11. - 12.11.2015) a letos bude poprvé připoraven v angličtině. Novinkou je také zavedení symbolického registračního poplatku - zvýhodněni jsou studenti a členové naší sekce HuBraM. Program workshopu naleznete v samostatném souboru.

Workshop bude doplněn 13.11. dopoledne dnem otevřených dveří a setkáním s uživateli. Současní i budoucí uživatelé a další zájemci jsou zváni k přátelské diskusi nad přístupovými pravidly, fungováním CF MAFIL a možnostmi popskytovaných služeb.

Za CF MAFIL srdečně zve
Michal Mikl

Vážení Hubramáci,

přijměte pozvání na vzdělávací workshop s tématem pokročilého fMRI, který se bude konat v Brně 9.4.2015 a bude přímo předcházet 11. olomouckému fMRI workshopu. Bližší informace jsou uvedeny v přiložené PDF pozvánce. Tématicky je program zaměřen na potlačení pohybových a fyziologických artefaktů, využití záznamu fyziologických dějů ve fMRI, různé problémy při zpracování fMRI dat (zejména analýze konektivity) a možnosti jejich řešení atd.

S pozdravem
Michal Mikl

9. - 10. 4. 2015 se koná olomoucký fMRI workshop,
pořádaný ve spolupráci s naší Sekcí pro funkční mapování mozku. 

Uzávěrka přihlášek je 15. 3. 2015.

Pozvaným řečníkem bude Prof. Giovanni
Buccino z Univ. Parma a Uni.
Catanzaro, známý studiemi pozorování akce / zrcadlových neuronů. Prof.
Buccino má h-index 30.

Petr Hluštík

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na pravidelný vzdělávací fMRI workshop pořádaný vždy na podzim v Brně, tenktokráte v termínu 14.11.2014. Workshop proběhne v budově A35 (oválná budova CEITEC, vstup z ulice Studentská) univerzitního kampusu Bohunice od 9:00 - zasedací místnost 145. Odpolední praktická část bude realizována v počítačové učebně IBA, budova A1, 6. patro. Bližsí informace jsou na pozvánce v příloze.


Za organizátory

Michal Mikl

Vážení hubramáci,

přijměte pozvání na Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku, který se uskuteční  27. března 2014 od 9:00 h v Univerzitním kampusu MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti neurozobrazování a funkčního mapování mozku bez ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa o problematice funkčního mapování mozku či obecně zobrazování pomocí MR tomografu. Velká část workshopu bude věnována morfometrickým metodám (voxel based morfometrie apod.) a dále přesahům a návaznostem mezi morfometrickými přístupy (resp. informace získanými z analýzy strukturních snímků) a funkčním mapováním mozku.

Tematicky bude workshop pokrývat tyto oblasti:
•    Základní principy morfometrických metod
•    Předzpracování strukturních (anatomických) snímků pomocí software SPM
•    Voxel-based morphometry (VBM), Source-based morphometry (SBM), Deformation-based morphometry (DBM)

Zdravíme fMRI FSL komunitu,

dvě novinky z FSL:

1) V poslední verzi se objevil v repozitářích NeuroDebianu balík pro akceleraci výpočtu pomocí výkonných grafických karet Nvidia. Vlastní zkušenosti bohužel zatím nemáme.

2) Popis a interpretace aktivovaných oblastí mozku je v(d)ěčné téma. Užitečným pomocníkem může být atlas z projektu neurosynth.org (viz tam) zabalíčkovaný pro Debian, a sice v "lehké" a "plné" verzi. V popisu balíku se uvádí:

Description: neurosynth - atlas for use with FSL, all 525 terms
NeuroSynth is a platform for large-scale, automated synthesis of functional magnetic resonance imaging (fMRI) data extracted from published articles.
This package provides an atlas for use with FSL (and FSLview in particular) containing prior and posterior probabilities expressed as z-scores of relevance of corresponding terms to any given brain location.  Statistical maps should correspond to the one currently found on http://beta.neurosynth.org.

fsl-neurosynth-atlas: All 525 terms are included.