Metodika mat/stat

Metodické texty

Vzdělávací workshop + den otevřených dveří CF MAFIL a setkání s uživateli

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na vzdělávcí workshop zaměřený na neurozobrazování (fMRI, morfometrie, DTI) a elektrofyziologii (EEG, simultánní elektrofyziologie v MR). Workshop bude dvoudenní (11.11. - 12.11.2015) a letos bude poprvé připoraven v angličtině. Novinkou je také zavedení symbolického registračního poplatku - zvýhodněni jsou studenti a členové naší sekce HuBraM. Program workshopu naleznete v samostatném souboru.

Workshop bude doplněn 13.11. dopoledne dnem otevřených dveří a setkáním s uživateli. Současní i budoucí uživatelé a další zájemci jsou zváni k přátelské diskusi nad přístupovými pravidly, fungováním CF MAFIL a možnostmi popskytovaných služeb.

Za CF MAFIL srdečně zve
Michal Mikl

Vzdělávací fmri workshop v Brně - pokročilé fMRI

Vážení Hubramáci,

přijměte pozvání na vzdělávací workshop s tématem pokročilého fMRI, který se bude konat v Brně 9.4.2015 a bude přímo předcházet 11. olomouckému fMRI workshopu. Bližší informace jsou uvedeny v přiložené PDF pozvánce. Tématicky je program zaměřen na potlačení pohybových a fyziologických artefaktů, využití záznamu fyziologických dějů ve fMRI, různé problémy při zpracování fMRI dat (zejména analýze konektivity) a možnosti jejich řešení atd.

S pozdravem
Michal Mikl

11. fMRI workshop v Olomouci

9. - 10. 4. 2015 se koná olomoucký fMRI workshop,
pořádaný ve spolupráci s naší Sekcí pro funkční mapování mozku. 

Uzávěrka přihlášek je 15. 3. 2015.

Pozvaným řečníkem bude Prof. Giovanni
Buccino z Univ. Parma a Uni.
Catanzaro, známý studiemi pozorování akce / zrcadlových neuronů. Prof.
Buccino má h-index 30.



Petr Hluštík

Vzdělávací fmri workshop

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na pravidelný vzdělávací fMRI workshop pořádaný vždy na podzim v Brně, tenktokráte v termínu 14.11.2014. Workshop proběhne v budově A35 (oválná budova CEITEC, vstup z ulice Studentská) univerzitního kampusu Bohunice od 9:00 - zasedací místnost 145. Odpolední praktická část bude realizována v počítačové učebně IBA, budova A1, 6. patro. Bližsí informace jsou na pozvánce v příloze.


Za organizátory

Michal Mikl

10. letní škola matematické biologie

Vážení kolegové a příznivci data-analytických krás,

Dovolujeme si Vás pozvat na letošní letní školu matematické biologie, která se uskuteční od 9. do 12. září 2014 v nově zrekonstruovaném Kaprálově mlýně v lůně přírody nedaleko Ochoze u Brna. Letošní jubilejní 10. ročník letní školy bude věnován následujícímu ústřednímu tématu: "Analýza a zpracování obrazových dat v neurovědách --- Image Data Analysis and Processing in Neuroscience". Vedle lektorů z řad vyučujících IBA MU pro vás zajistí zajímavé přednášky a cvičení také odborníci z Fakultní nemocnice Brno, ze Středoevropského technologického institutu CEITEC, z pražské techniky ČVUT a dále také ze zahraničí: prof. Giovanni Montana z Velké Británie a Dr. René Mandl z Holandska.

Virtuální MR skener - kdo si hraje, nezlobí !

V repozitářích neurodebianu jsem náhodou nalezl balíček virtual-mri-nonfree. Tento balíček je k dispozici i pro Ubuntu. Pokud tedy používáte operační systém GNU/Linux vycházející z Debianu (Debian, NeuroDebian, Ubuntu, Mint atd), stačí napsat apt-get install virtual-mri-nonfree a spustit program virtual-mri. Uživatelé Windows a Mac OS X mohou program stáhnout na stránkách projektu - je v Javě a tudíž by s instalací neměl být problém. Aplikace je z roku 2006, ale stále pěkná !
Pokud kliknete na druhou ikonku vpravo nahoře, místo fantomu budete měřit mozek (měří se příkazem start). Existují nástroje pro program imagej, kterými můžete předpřipravit vlastní data - to se mi ale zatím nepodařilo rozchodit - pokud se vám podaří, podělte se v diskuzi ! Přeji dobrou zábavu !

screenshot

Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku

Vážení hubramáci,

přijměte pozvání na Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku, který se uskuteční  27. března 2014 od 9:00 h v Univerzitním kampusu MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti neurozobrazování a funkčního mapování mozku bez ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa o problematice funkčního mapování mozku či obecně zobrazování pomocí MR tomografu. Velká část workshopu bude věnována morfometrickým metodám (voxel based morfometrie apod.) a dále přesahům a návaznostem mezi morfometrickými přístupy (resp. informace získanými z analýzy strukturních snímků) a funkčním mapováním mozku.

Tematicky bude workshop pokrývat tyto oblasti:
•    Základní principy morfometrických metod
•    Předzpracování strukturních (anatomických) snímků pomocí software SPM
•    Voxel-based morphometry (VBM), Source-based morphometry (SBM), Deformation-based morphometry (DBM)

Vzdělávací workshop v Brně - základy fMRI včetně praktické části analýzy fMRI dat

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na vzdělávací workshop zaměřený na principy fMRI a základy zpracování fMRI dat. Wokrshop proběhne 6.12.2013 v Brně (univerzitní kampus MU, Brno-Bohunice) od 9:00 a bude obsahovat dopolední teoretickou a odpolední praktickou část (v počítačové učebně, zaměření na zpracování fMRI dat v programu SPM). Vstup na akci je zdarma, ale je nutná registrace emailem na adresu michal.mikl@ceitec.muni.cz
Kapacita praktické odpolední části je omezená cca na 20 osob.
Bližší informace v přiložené pozvánce.

Vzdělávací fMRI workshop se zaměřením na konektivitu

Vážení Hubramáci,

přijměte pozvání na vzdělávací fMRI workshop se zaměřením na konektivitu, který bude realizován v Brně 4.4.2013 od 8:00 h do 12:00 h. Tato akce je spolupořádaná naší sekcí a přímo předchází 9. mezinárodnímu olomouckému fMRI workshopu, který začíná tentýž den cca od 17:00. Z Brna do Olomouce jsou poměrně rozumné možnosti přesunu autobusem, vlakem nebo automobilem.

Místo konání: Univerzitní kampus MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti fMRI bez
ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa
o problematice funkčního mapování pomocí fMRI, protože obecné základy budou
zmíněny jen ve velmi omezené míře a většina prostoru bude věnována konektivitě.

Podrobný program zde bude následně doplněn. Přiložena je pozvánka v PDF s programem workshopu.

Účast na workshopu je bezplatná, ale prosíme o registraci na emailovou adresu michal.mikl@ceitec.muni.cz



Vzdělávací fMRI workshop v Brně

Vážení hubramáci,

dovoluji si vás pozvat na vzdělávací workshop, který budeme realizova 25.4.2012 v Brně (posluchárna neurologické kliniky, budova C, FN u sv. Anny, Pekařská 53, Brno). Začátek workshopu bude v 9:00 a předpokládaný konec mezi 13:00 a 14:00. Uprostřed bude přestávka se zajištěním (snad) nějakého občerstvení.
Obsah workshopu by měl pokrát následující témata: Princip fMRI, základní i pokročilá analýza fMRI dat (GLM/SPM, ICA), konektivita, artefakty a šum ve fMRI, modelování HRF, základy EEG-fMRI a související. V nejbližších dnech zde a na http://fmri.mchmi.com zveřejníme podrobnější program. Workshop bude směřován především pro PHD studenty, začínající výzkumníky v oblasti fMRI a další osoby, které se o fMRI (a zejména analýze fMRI dat) chtějí něco více dovědět a nyní mají jen základní povědomí.
Účast na akci je zdarma, ale prosíme o registraci z důvodu kapacity. Registrujte se emailem (michal.mikl@ceitec.muni.cz) s uvedením svého jména a instituce.

Syndikovat obsah