Metodika mat/stat

Metodické texty

11. fMRI workshop v Olomouci

9. - 10. 4. 2015 se koná olomoucký fMRI workshop,
pořádaný ve spolupráci s naší Sekcí pro funkční mapování mozku. 

Uzávěrka přihlášek je 15. 3. 2015.

Pozvaným řečníkem bude Prof. Giovanni
Buccino z Univ. Parma a Uni.
Catanzaro, známý studiemi pozorování akce / zrcadlových neuronů. Prof.
Buccino má h-index 30.



Petr Hluštík

Vzdělávací fmri workshop

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na pravidelný vzdělávací fMRI workshop pořádaný vždy na podzim v Brně, tenktokráte v termínu 14.11.2014. Workshop proběhne v budově A35 (oválná budova CEITEC, vstup z ulice Studentská) univerzitního kampusu Bohunice od 9:00 - zasedací místnost 145. Odpolední praktická část bude realizována v počítačové učebně IBA, budova A1, 6. patro. Bližsí informace jsou na pozvánce v příloze.


Za organizátory

Michal Mikl

10. letní škola matematické biologie

Vážení kolegové a příznivci data-analytických krás,

Dovolujeme si Vás pozvat na letošní letní školu matematické biologie, která se uskuteční od 9. do 12. září 2014 v nově zrekonstruovaném Kaprálově mlýně v lůně přírody nedaleko Ochoze u Brna. Letošní jubilejní 10. ročník letní školy bude věnován následujícímu ústřednímu tématu: "Analýza a zpracování obrazových dat v neurovědách --- Image Data Analysis and Processing in Neuroscience". Vedle lektorů z řad vyučujících IBA MU pro vás zajistí zajímavé přednášky a cvičení také odborníci z Fakultní nemocnice Brno, ze Středoevropského technologického institutu CEITEC, z pražské techniky ČVUT a dále také ze zahraničí: prof. Giovanni Montana z Velké Británie a Dr. René Mandl z Holandska.

Virtuální MR skener - kdo si hraje, nezlobí !

V repozitářích neurodebianu jsem náhodou nalezl balíček virtual-mri-nonfree. Tento balíček je k dispozici i pro Ubuntu. Pokud tedy používáte operační systém GNU/Linux vycházející z Debianu (Debian, NeuroDebian, Ubuntu, Mint atd), stačí napsat apt-get install virtual-mri-nonfree a spustit program virtual-mri. Uživatelé Windows a Mac OS X mohou program stáhnout na stránkách projektu - je v Javě a tudíž by s instalací neměl být problém. Aplikace je z roku 2006, ale stále pěkná !
Pokud kliknete na druhou ikonku vpravo nahoře, místo fantomu budete měřit mozek (měří se příkazem start). Existují nástroje pro program imagej, kterými můžete předpřipravit vlastní data - to se mi ale zatím nepodařilo rozchodit - pokud se vám podaří, podělte se v diskuzi ! Přeji dobrou zábavu !

screenshot

Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku

Vážení hubramáci,

přijměte pozvání na Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku, který se uskuteční  27. března 2014 od 9:00 h v Univerzitním kampusu MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti neurozobrazování a funkčního mapování mozku bez ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa o problematice funkčního mapování mozku či obecně zobrazování pomocí MR tomografu. Velká část workshopu bude věnována morfometrickým metodám (voxel based morfometrie apod.) a dále přesahům a návaznostem mezi morfometrickými přístupy (resp. informace získanými z analýzy strukturních snímků) a funkčním mapováním mozku.

Tematicky bude workshop pokrývat tyto oblasti:
•    Základní principy morfometrických metod
•    Předzpracování strukturních (anatomických) snímků pomocí software SPM
•    Voxel-based morphometry (VBM), Source-based morphometry (SBM), Deformation-based morphometry (DBM)

Vzdělávací workshop v Brně - základy fMRI včetně praktické části analýzy fMRI dat

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na vzdělávací workshop zaměřený na principy fMRI a základy zpracování fMRI dat. Wokrshop proběhne 6.12.2013 v Brně (univerzitní kampus MU, Brno-Bohunice) od 9:00 a bude obsahovat dopolední teoretickou a odpolední praktickou část (v počítačové učebně, zaměření na zpracování fMRI dat v programu SPM). Vstup na akci je zdarma, ale je nutná registrace emailem na adresu michal.mikl@ceitec.muni.cz
Kapacita praktické odpolední části je omezená cca na 20 osob.
Bližší informace v přiložené pozvánce.

Vzdělávací fMRI workshop se zaměřením na konektivitu

Vážení Hubramáci,

přijměte pozvání na vzdělávací fMRI workshop se zaměřením na konektivitu, který bude realizován v Brně 4.4.2013 od 8:00 h do 12:00 h. Tato akce je spolupořádaná naší sekcí a přímo předchází 9. mezinárodnímu olomouckému fMRI workshopu, který začíná tentýž den cca od 17:00. Z Brna do Olomouce jsou poměrně rozumné možnosti přesunu autobusem, vlakem nebo automobilem.

Místo konání: Univerzitní kampus MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti fMRI bez
ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa
o problematice funkčního mapování pomocí fMRI, protože obecné základy budou
zmíněny jen ve velmi omezené míře a většina prostoru bude věnována konektivitě.

Podrobný program zde bude následně doplněn. Přiložena je pozvánka v PDF s programem workshopu.

Účast na workshopu je bezplatná, ale prosíme o registraci na emailovou adresu michal.mikl@ceitec.muni.cz



Vzdělávací fMRI workshop v Brně

Vážení hubramáci,

dovoluji si vás pozvat na vzdělávací workshop, který budeme realizova 25.4.2012 v Brně (posluchárna neurologické kliniky, budova C, FN u sv. Anny, Pekařská 53, Brno). Začátek workshopu bude v 9:00 a předpokládaný konec mezi 13:00 a 14:00. Uprostřed bude přestávka se zajištěním (snad) nějakého občerstvení.
Obsah workshopu by měl pokrát následující témata: Princip fMRI, základní i pokročilá analýza fMRI dat (GLM/SPM, ICA), konektivita, artefakty a šum ve fMRI, modelování HRF, základy EEG-fMRI a související. V nejbližších dnech zde a na http://fmri.mchmi.com zveřejníme podrobnější program. Workshop bude směřován především pro PHD studenty, začínající výzkumníky v oblasti fMRI a další osoby, které se o fMRI (a zejména analýze fMRI dat) chtějí něco více dovědět a nyní mají jen základní povědomí.
Účast na akci je zdarma, ale prosíme o registraci z důvodu kapacity. Registrujte se emailem (michal.mikl@ceitec.muni.cz) s uvedením svého jména a instituce.

Vzdělávací workshop v rámci akce "10 let fMRI v Brně"

Vážení HuBraMáci,v návaznosti na příspěvek ke škole klinické neurofyziologie a snahu o zpřístupnění vzdělávacích materiálů si dovolím zmínit akci, která proběhla v Brně v prosinci 2010. Jelikož fMRI výzkum v Brně slavil v roce 2010 již desetileté výročí, uspořádali jsme seminář, na němž byly představeny průřezově témata, kterými se nerozobrazovací brněnský tým zabýval, následovaný vzdělávacím workshopem, na němž jsme se snažili vysvětlit principy funkční magnetické rezonance, základní i některé pokročilé přístupy v analýze fMRI dat a témata z analýzy konektivity. Prezetnace ze vzdělávací části jsou nyní pro členy HuBraMu přístupné pod správcem souborů v adresáři users/10 let fMRI v Brně a přímé odkazy jsou umístěné i v tomto článku.

Škola klinické neurofyziologie 2011

Vážení HuBraMáci,

Syndikovat obsah